Η διοίκηση της ΕΠΕ διενεργεί πράξεις στο όνομα και για λογαριασμό της ΕΠΕ, συνεπώς δεν ευθύνεται για τα χρέη της εταιρείας, όμως υπάρχει σχετική εξαίρεση για τα χρέη προς το Δημόσιο
Διοικητικό Πρωτοδικείο Αθηνών 2695/2012
Ο διαχειριστής μιας ΕΠΕ ως διοικών αυτήν, δεν ευθύνεται για τα χρέη της εταιρείας προς ιδιώτες και εταιρείες, καθώς ευθύνεται μόνο η εταιρεία με την περιουσία της. Ωστόσο, η νομική αντιμετώπιση είναι διαφορετική και χρήζει προσοχής όταν πρόκειται για χρέη της ΕΠΕ προς το Δημόσιο (φόροι, τέλη κλπ.). Ο διαχειριστής ευθύνεται μαζί με την εταιρεία για τους φόρους όπως π.χ. ο ΦΠΑ. Δηλαδή η διοίκηση της ΕΠΕ και η εταιρεία ευθύνονται αλληλεγγύως και εις ολόκληρον με την ΕΠΕ και με την ατομική τους περιουσία. Αυτό ισχύει ακόμα και κατά τον χρόνο κήρυξης της πτώχευσης ή γενικά διάλυσης της εταιρείας. Τα πρόσωπα αυτά δεν αποκτούν ιδία φορολογική υποχρέωση και δεν νομιμοποιούνται να ασκήσουν προσφυγή κατά της καταλογιστικής πράξης. Ωστόσο, υπάρχει νομική προστασία και αυτή είναι η άσκηση ανακοπής κατά της διαδικασίας εκτέλεσης.
